Introduction à OMERO.web OMERO.web est l’interface graphique de OMERO sur navigateur web. Pour accéder à l’interface, il faut taper l’adresse du serveur dans le navigateur : La liste des adresses des serveurs est accessible depuis https://omero-fbi.fr/.
Par exemple: https://nantes.omero-fbi.fr/
https://bordeaux.omero-fbi.fr/
L’interface suivante s’affiche, vous permettant de vous connecter sous vos identifiants.
Recommandations de nommage et d’organisation 1. Notion de REMBI (Recommended Metadata for Biological Images) Réutiliser les images et les données associées, à des fins d’étude ou de reproductibilité a toujours été un problème en imagerie, et particulièrement en microscopie. Une piste sur les métadonnées à acquérir pour chaque image a été théorisée dans la littérature (https://www.
Téléchargement des fichiers image d’origine depuis OMERO 1. Un ou plusieurs fichiers, taille totale inférieure à 1.0 Gb Le téléchargement se fera depuis OMERO.web.
Sélectionnez votre ou vos images (pas les projets ou les datasets) Cliquer sur le bouton de téléchargement de l’interface d’OMERO (région droite, flèche pointant vers le bas) Cliquer sur “Download” pour télécharger les fichiers images aux formats d’origine Si un seul fichier a été sélectionné, le téléchargement se lancera directement.
Hello and welcome,
In this blog, we’ll try to keep you updated on our activities, publish howtos and help for biologists and for throw out some ideas.
Let’s start by presenting our project!
As you can read on our portal, and surmise from the website address, our first goal is to deploy OMERO in the various France Bioimaging microscopy platforms.